Étude de l’ADP-ribosylation de l’ADN en réponse au stress génotoxique

Responsable du Stage : Alexander ISHCHENKO

Tél : 01 42 11 54 05 ;   Fax : 01 42 11 50 08 ;  E-mail:  Alexander.ISHCHENKO@gustaveroussy.fr

Institut Gustave Roussy

Résumé du Projet de Stage 

La famille des poly(ADP-ribose) polymérases (PARP) catalyse l’ADP-ribosylation des protéines qui régule un certain nombre de processus biologiques, notamment la réponse aux dommages à l’ADN, la réorganisation de la chromatine, la régulation transcriptionnelle, l’apoptose, la mitose et le métabolisme cellulaire. Récemment, nous avon démontré que les PARP 1, 2 et 3 modifient non seulement les protéines mais aussi les extrémités de l’ADN. Cependant, les mécanismes l’ADP-ribosylation de l’ADN dans les cellules vivantes et son rôle dans la réponse aux dommages à l’ADN restent inconnus. Dans ce projet en utilisant les approches biochimiques, protéomiques et cellulaires nous proposons de révéler les mécanismes moléculaires de ce nouveau type de modification de l’ADN et son rôle dans la réponse aux dommages à l’ADN. De nouveaux outils seront développés pour détecter et caractériser ces adduits dans l’ADN génomique après des traitements génotoxiques. Les protéines responsables de la détection et de la signalisation des adduits ADP-ribosylés à l’ADN seront identifiées et caractérisées.

Dernières publications

  1. Matta E, Kiribayeva A, Khassenov B, Matkarimov BT, Ishchenko AA. Insight into DNA substrate specificity of PARP1-catalysed DNA poly(ADP-ribosyl)ation. // Scientific Reports, 2020, 10, e3699. https://doi.org/10.1038/s41598-020-60631-0
  2. Sutcu HH, Matta E, Ishchenko AA. Role of PARP-catalyzed ADP-ribosylation in the Crosstalk Between DNA Strand Breaks and Epigenetic Regulation. // J. Mol. Biol., 2020 432, 1769 -1791. http://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2019.12.019
  3. Belousova E.A., Ishchenko A.A., Lavrik O.I. “DNA is a new target of PARP3”. // Scientific Reports, 2018, 8, 4176. https://doi.org/10.1038/s41598-018-22673-3
  4. Zarkovic G., Belousova E.A., Talhaoui I., Saint-Pierre C., Kutuzov M.M., Matkarimov B.T., Biard D., Gasparutto D., Lavrik O.I., Ishchenko A.A. Characterization of DNA ADP-ribosyltransferase activities of PARP2 and PARP3: new insights into DNA ADP-ribosylation. // Nucleic Acids Res., 2018, 46, 2417–31. http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkx1318.
  5. Talhaoui I., Lebedeva N.A., Zarkovic G., Saint-Pierre C., Kutuzov M.M., Sukhanova M.V., Matkarimov B.T., Gasparutto D., Saparbaev M.K., Lavrik O.I. and Ishchenko A.A. “ Poly(ADP-ribose) polymerases covalently modify strand break termini in DNA fragments in vitro”. Nucleic Acids Res., 2016, 44, 9279-95. http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkw675

Ce projet s’inscrit-il dans la perspective d’une thèse :
oui X

si oui type de financement prévu : Université Paris-Saclay (Ministère de l’Education Nationale)

Fiche accueil M2-BMC-2021-2022 Ishchenko

Equipe d’Accueil : Mécanismes de réparation de l’ADN et Cancérogenèse

Intitulé de l’Unité : Intégrité du Génome et Cancers – UMR 9019 CNRS

Nom du Responsable de l’Unité : Patricia KANNOUCHE

Nom du Responsable de l’Équipe : Murat SAPARBAEV

Adresse :  Gustave Roussy – PR2; 114, rue Edouard Vaillant; 94805 – VILLEJUIF