Etude du rôle d’un polymorphisme génétique au sein du locus TCRD sur la thymopoïèse chez l’homme
Responsable du Stage : Emmanuel Clave
Tél ; Fax et E-mail: 0142494640 ; 0142494641, emmanuel.clave@univ-paris-diderot.fr
IRSL, Hôpital Saint-Louis
Résumé du Projet de Stage
Le projet fait suite aux travaux du laboratoire (Clave et al., Sci Transl Med 2018) qui ont mis en évidence l’existence d’un contrôle génétique de la production lymphocytaire T chez l’homme. Ce travail a montré que la fonction thymique en situation physiologique est dépendante, non seulement de l’âge et du sexe mais aussi d’un variant génétique (polymorphisme G/A du SNPrs2204985) situé au sein du locus du récepteur du lymphocyte T (TCR) TCRA-TCRD et plus précisément entre les segments DD2 et DD3 du locus codant la chaîne delta du TCR. L’effet de ce polymorphisme est reproduit lors de la greffe de cellules souches hématopoïétiques (GG vs. AA) à des souris immunodéficientes. Le projet vise à obtenir des données sur les mécanismes par lesquels ce polymorphisme agit sur la recombinaison du locus TCR et sur la thymopoïèse. L’étude de thymocytes isolés à partir de prélèvements de thymus humains sera privilégiée ainsi que la mise en place d’un système d’organoïdes thymiques in vitro. Le projet fera appel à des méthodologies de biologie cellulaire (isolement de sous-populations thymocytaires et phénotypage par FACS des populations thymocytaires exprimant un récepteur T ab et gd) et moléculaire (transcriptome, RNAseq, analyse sur cellules isolées « single cell »). Ce travail pourrait déboucher dans un projet de thèse par des analyses épigénétiques et de conformation chromatinienne ainsi que par des analyses in vivo dans le modèle de souris immunodéficientes (souris « humanisées » HIS). Il s’intègre dans un projet récemment financé par l’ANR (ANR 2021 «Hu-Thy-L »).
Références:
- The role of the thymus in allogeneic bone marrow transplantation and the recovery of the peripheral T-cell compartment. Velardi E, Clave E, Arruda LCM, Benini F, Locatelli F,Toubert A.Semin Immunopathol. 2021 Feb;43(1):101-117. doi: 10.1007/s00281-020-00828-7.
- Human thymopoiesis is influenced by a common genetic variant within theTCRA-TCRD Clave E, Araujo IL, Alanio C, Patin E, Bergstedt J, Urrutia A, Lopez-Lastra S, Li Y, Charbit B, MacPherson CR, Hasan M, Melo-Lima BL, Douay C, Saut N, Germain M, Trégouët DA, Morange PE, Fontes M, Duffy D, Di Santo JP, Quintana-Murci L, Albert ML, Toubert A; Milieu Intérieur Consortium.Sci Transl Med. 2018 Sep 5;10(457). pii: eaao2966.
Ce projet s’inscrit-il dans la perspective d’une thèse :
oui x
non o
si oui type de financement prévu : Concours ED
Ecole Doctorale de rattachement : ED H-O-B
Intitulé de l’Unité : INSERM UMRS 1160 Ecotaxie, microenvironnement et développement lymphocytaire
Equipe d’Accueil : Développement lymphocytaire et fonction thymique
Nom du Responsable de l’Unité : Antoine Toubert
Nom du Responsable de l’Équipe : Antoine Toubert
Adresse : IRSL, Hôpital Saint-Louis, centre G. Hayem, 1 Av. C. Vellefaux 75010 Paris.