Biologie intégrative et synthétique des microorganismes

Responsables

Annick Mejean – Aurore Vidy

Appréhender les apports récents de la génomique et des outils d’analyse multi-échelle permettant l’étude de microorganismes (virus, bactéries, microorganismes eucaryotes) en interaction avec d’autres systèmes biologiques, afin de mieux comprendre et contrôler les conséquences de ces interactions.
Comprendre les approches permettant la manipulation efficace des génomes des microorganismes afin de construire des systèmes biologiques synthétiques possédant de nouvelles fonctions ou permettant la bioproduction de molécules d’intérêt.

Utilisation des méthodes d’analyse ciblée et à grande échelle pour réaliser des études de microbiologie ou virologie intégrative
Régulations multi échelle, physiologie intégrative et biologie des systèmes
Biologie de synthèse et stratégies de bioproduction chez des microorganismes procaryotes, eucaryotes et des virus
Présentation des défis iGem

Microprojet de microbiologie de synthèse et/ou intégrative (bactériologie, microbiologie eucaryote ou virologie)

Travail personnel en groupe : analyse critique du projet, choix libre d’une approche originale de la thématique, méthodologie, bibliographie, réflexion sur les perspectives
Présentation orale, avec support (diaporama), de l’analyse du projet étudié (état de l’art, objectifs, mise en œuvre, conclusion, applications possibles du projet)
Exemples de présentations de groupes d’étudiants pour les soutenances orales : présentation de microbiologie et présentation de virologie

Acquérir les grands principes de manipulation des génomes viraux, bactériens ou d’autres microorganismes à des fins :
- de production de protéines
- d’obtention de nouvelles fonctions métaboliques
- d’applications vaccinales, thérapeutiques ou à visée oncolytique
Notions d’analyses multi-échelle de systèmes d’infection/prolifération de microorganismes (virus, bactéries, microorganismes eucaryotes)