GENOMIQUE DES MICRO-ORGANISMES

Responsable

Hervé Lalucque

Equipe enseignante

Hervé Lalucque, Isabelle Vertraete

Mots Clés

Micro-organismes, bactéries, microorganismes eucaryotes, virus, génomique, diversité génétique, bioinformatique

Objectifs

* Approfondir les bases de la génomique : exploration des outils et méthodes pour analyser les génomes microbiens et viraux.

* Étudier la diversité génétique : identification des mécanismes d’évolution, d’adaptation et d’interactions des bactéries.

* Appliquer la génomique fonctionnelle : identification des gènes à partir d’un nouvel assemblage génomique et les relier aux fonctions biologiques

* Analyser les mécanismes d’évolution du génome viral, afin de comprendre leur rôle dans l’émergence de nouvelles souches et leur adaptation aux hôtes et environnements

Lors des TP/TD, la génomique fonctionnelle sera approfondie à travers l’analyse d’un jeu de données génomiques réels. Les activités incluront l’annotation des gènes et l’identification de clusters de biosynthèse dans des génomes fongiques

Forme des enseignements

16h de CM et 8h de TD/TP

Compétences visées

• Se servir de façon autonome des outils numériques avancés
• Développer une conscience critique des savoirs
• Identifier les usages numériques et les impacts de leur évolution sur le ou les domaines concernés par la mention