M1-S2 : Structure et dynamique des macromolécules biologiques

Responsables

Claudine Mayer – Catherine Etchebest

Objectifs

Les enseignements proposés visent à doter les étudiants de compétences en biologie structurale intégrative. Il s’agit en particulier de montrer l’importance der la connaissance de la structure fine et de la dynamique des macromolécules biologiques dans leur mécanisme fonctionnel. Adossés à un enseignement théorique sur les approches de pointe en biologie structurale, des travaux pratiques vont permettre à l’étudiant de se confronter aux problématiques concrètes rencontrées lors de l’étude structurale d’un système biologique.

Cours Magistraux 30h

Résolution des structures :

• Introduction a la biologie structurale
• Diffraction des rayons X
• RMN (2 séances)
• Microscopie électronique
• Diffusion lumière/RX

Dynamique fonctionnelle des macromolécules :

• Méthodes de simulation : 3 séances x 3h
• Modélisation des interactions : Notion de champ de forces
• Optimisation d’une structure
• Concepts, outils et analyses de la dynamique moléculaire

Travaux Dirigés 18h

Résolution des structures :

• Cristallographie
• RMN TD4 : exemple intégratif
• Microscopie électronique

Dynamique fonctionnelle des macromolécules : Travaux pratiques sur ordinateur TD/TP : 5 séances 

• Construction d’un système modèle.
• Exploration de l’état optimal du système
• Simulation de la dynamique d’une macromolécule (2 séances)
• Analyse statistique des mouvements et changements conformationnels 

Compétences visées

• Contribuer à la conception et à la mise en œuvre de projets de recherche fondamentaux ou appliqués en biologie structurale in silico et expérimentale
• Obtenir et analyser des données scientifiques avec les outils numériques de référence
• Comprendre une démarche scientifique et expérimentale rigoureuse
• Aptitude à la diffusion écrite et orale d’informations et résultats scientifiques
• Maîtrise de l’anglais scientifique
• Aptitude à s’exprimer et débattre